På datorer som kör Windows NT Workstation, Windows NT Server eller Windows NT Server, Enterprise Edition, är alla meddelandefiler, loggfiler och LQS-filer i MSMQ skyddade på enheter som är formaterade med NTFS. Endast medlemmar i gruppen Administratörer på den lokala datorn har fullständig behörighet till dessa filer. Inga andra användare kan komma åt dem.
Som standard är filsäkerhet inställd för mapparna \Storage och \LQS. Varje gång en fil skapas i någon av dessa mappar "ärver" den nya filen mappens säkerhetsinställningar. Om du flyttar en fil till en annan mapp med ikonen för MS Message Queue på Kontrollpanelen, kommer dessa säkerhetsinställningar dock inte att kopieras till de nya mapparna (eftersom du kanske använder eller vill använda mapparna för att lagra andra filer). Observera att filerna som flyttas från sina standardmappar till nya mappar flyttas med sina standardinställningar för säkerhet. Om du vill skydda MSMQ-filer när du har använt ikonen för MS Message Queue på Kontrollpanelen och angivit nya mappar för lagring av meddelandefiler, loggfiler eller transaktionsloggfiler går du till "Ändra säkerhetsinställningar för filer och mappar i MSMQ" i avsnittet "Hantera MSMQ".