Alla MSMQ-köer kan, oavsett funktion, hanteras med samma MSMQ-funktioner. Detta gäller de privata och offentliga köer som används när meddelanden skickas och tas emot samt de köer för journaler, förlorade meddelanden, förlorade transaktionsmeddelanden, administration och rapporter som lägger till funktionalitet i MSMQ-program. Varje kö som beskrivs i följande avsnitt är helt enkelt en standardkö i MSMQ som används för ett särskilt syfte.
I MSMQ Explorer används en uppsättning ikoner för att visa de olika köerna. Om du vill se en tabell över ikoner för datorer, köer och meddelanden klickar du på Hjälpavsnitt på Hjälp-menyn i MSMQ Explorer, dubbelklickar på Översikt och dubbelklickar på MSMQ Explorer-ikonerna.